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Schulungsübersicht
Einführung in Fiji und ImageJ
- Überblick über Fiji und seine Anwendungen in der wissenschaftlichen Forschung
- Verständnis der Architektur und Plugins von ImageJ
- Installation und Einrichtung von Fiji für optimale Leistung
Grundlegende Techniken der Bildverarbeitung
- Bildakquise und Importformate
- Anpassung von Kontrast, Helligkeit und Anwendung von Filtern
- Methoden zum Stapeln und Projizieren von Bildern
Fortgeschrittene Bildanalyse
- Segmentierungstechniken: Schwellwertbildung und Kantendetektion
- Objekterkennung und Partikelanalyse in histologischen Proben
- Messung von Flächen, Umfängen und anderen morphologischen Merkmalen
Arbeit mit biologischen Proben
- Verarbeitung von Bildern histologischer Gewebe, Blutkörperchen und Algen
- Farbdekonvolution und Analyse gefärbter Gewebe
- Time-Lapse-Analyse und Nachverfolgung der Zellbewegung
Automatisierung und Anpassung
- Erstellen und Ausführen von Makros für wiederkehrende Aufgaben
- Nutzung von Fiji-Plugins für spezialisierte Analysen
- Grundlegendes Skripten in der ImageJ-Makrosprache (IJM)
Datenverwaltung und Berichtswesen
- Exportieren von Ergebnissen und Erstellen von Berichten
- Anmerkung von Bildern und Vorbereitung der Daten für die Veröffentlichung
- Best Practices für reproduzierbare Bildanalyse
Voraussetzungen
- Grundlegendes Verständnis der Konzepte der biologischen Bildgebung
- Vertrautheit mit Mikroskopie und histologischen Techniken
- Grundlegende Computerkompetenz
Zielgruppe
- Forscher in der Biotechnologie und Umwelttoxikologie
- Laboranten, die mit histologischer und zellulärer Bildgebung arbeiten
- Wissenschaftler, die sich für quantitative Bildanalyse interessieren
14 Stunden
