Schulungsübersicht

Einführung in die Programmiersprache Python.

  • Warum Python?
  • Verwendung von Python zum Umgang mit biologischen Daten
  • Arbeiten mit der iPython-Shell
  • Dein erstes Programm
  • Schreiben von Python Skripten
  • Module importieren

Arbeiten mit Protein- und RNA/DNA-Sequenzen

  • Motive finden
  • Transkription und Übersetzung in silico
  • Umgang mit Sequenzausrichtungen

Parsen von Daten in verschiedenen biologischen Formaten

  • FASTA analysieren
  • Konvertierungen von Datenformaten

Durchführung biologischer Analysen

  • EXPLOSION
  • Accessing biologische Webdienste

Umgang mit biologischen 3D-Strukturen mit Python

Python erleichtert die statistische Analyse

Daten visualisieren

  • Erstellen von Balken- und Streudiagrammen
  • Berechnen einer Fläche unter der Kurve (AUC)

Arbeiten mit XLS- und CSV-Dateien

  • Importieren von Daten aus und Exportieren nach MS Excel / OpenOffice Calc
  • Schreiben von XLS- und CSV-Dateien

Verwenden von Python zum Erstellen einer automatisierten Datenverarbeitungspipeline

Voraussetzungen

Biologische Grundkenntnisse über Protein-, RNA- und DNA-Sequenzen.

  28 Stunden
 

Teilnehmerzahl


Beginnt

Endet


Die Termine sind abhängig von der Verfügbarkeit und finden zwischen 09:30 und 16:30 statt.
Offene Schulungskurse erfordern mindestens 5 Teilnehmer.

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